临床上，有些疾病西医西药已有明确的疗效，这类疾病以细菌感染性疾病为主，就可选择直接看西医(尽管说抗菌药物的发明、发现才能算是现代医学最成功的地方，但其造成的自然界微生物生态环境破坏，也已经越来越显现出来它相反作用来)。但多数疾病西医西药都只能起到短期内“控制”症状的效果，许多疾病都还不明原因，当然也就没有任何疗效。对于大多数西医疗效不佳或无效的疾病，最好选择中医治疗。
西医西药疗效好的疾病，如细菌感染类疾病，临床上多见有急性感染性的肺炎、急性腹膜炎、急性尿路感染、皮肤部位的各种化脓性感染性疾病、部分性传播性疾病(梅毒、淋病、非淋菌性尿道炎等)、菌血症等等，因为西医主要使用的抗菌药物对此类疾病有很好的疗效，且对病菌的治疗也有针对性，故，建议选用看西医为好。虽然中药的疗效也不错，但因针对性不强，用药又需要准确的辨证(因没有相对客观的指标，准确辨证需要较深厚的中医临床技能，而熟练掌握这些中医的技能需要不少的临床经验积累)，没有丰富临床经验的中医师，较难做出正确辨证，故中医已不在此治疗类疾病的首选使用之列了。
中医治疗有优势的疾病，如慢性前列腺炎，特别是慢性无菌性前列腺炎(也就是“前列腺功能失调症”)，目前看，西医的治疗效果还不理想，而中医的治疗更有针对性，效果也较好，所以，建议去看中医男科;又如慢性萎缩性胃炎的治疗，西医也没有什么特别好的办法，可去看中医;还如偏头痛那种病，西医也没有什么好的治疗办法，而看中医多能解决问题。还有许多慢性疾病，如老年痴呆、Ⅱ型糖尿病、白血病、各种肿瘤、男性不育、女性不孕、痛经、月经不调、重病之后的调理等，都是中医的优势所在。
